Bem, o problema retornou no dia seguinte ou dois e, como inicialmente suspeitei que fosse o dock do Cairo, o monitor da CPU estava fazendo com que a CPU ficasse sob carga pesada. Assim que eu o desativei, a carga estava quase 1%, mas quando eu testei rodando programas diferentes, não havia praticamente nenhum ar saindo e sem calor. Quando eu verifico periodicamente, abrindo o monitor do sistema, as únicas leituras de CPU que recebo são da execução do monitor do sistema. Outra coisa que eu notei foi que o ram não estava sendo tão usado, a porcentagem antes era de 80% +. Agora é uma fração disso! Acho que atualizar o BIOS foi uma boa ideia, já que isso ajudou, mas o problema real era aquele applet que eu estava rodando. Eu verifiquei todos os applets diferentes e reduzi-o a esse. Portanto, para qualquer outra pessoa que esteja administrando o Cairo Dock, tenha cuidado com esse applet.