O truque com --panning
é que ele quer seguir o cursor do mouse. Então, se você mudar o ponteiro do mouse para o local desejado, o movimento deve seguir.
Instale o pacote xdotool
e tente o seguinte:
xrandr --output LVDS1 --rate 60 --mode 1366x768 --fb 2000x1500 --panning 2000x1500
xdotool mousemove 0 1500
Isso moverá o cursor do mouse para o canto inferior esquerdo e sua janela será exibida.
xdotool
também tem um comando getmouseposition
que pode ser usado para salvar a posição do mouse, para que você possa decidir se deseja mover o mouse de volta para onde estava depois.