Encontrei. cat files.txt | xargs rm -rf
Assim, para desinstalar os aplicativos do sistema compilado com python, siga estas etapas
1) Faça o download do código-fonte da versão exsact do aplicativo, caso ainda não o tenha
2) Extraia o arquivo e cd nos arquivos extraídos
3) Executar como root python setup.py install --record files.txt
4) Agora execute como root cat files.txt | xargs rm -rf
O aplicativo agora deve ser desinstalado. Se necessário, vá limpar todos os arquivos de configuração e configuração em seu diretório inicial para recuperar um pouco mais de espaço.