Eu suponho que você usa uma distro baseada em Debian e você baixou e descompactou libftd2xx-x86_64-1.4.6.tgz corretamente.
Siga as instruções de README .
Depois, você precisa copiar os arquivos de cabeçalho:% ftd2xx.h e WinTypes.h
para /usr/local/include e finalmente:
cd to (YourPath)/libftd2xx-x86_64-1.4.6/release/examples and finally run
make -B command