como grep word com hífen / traço de Um arquivo em uma coluna de arquivo B

Question

Eu tenho um arquivo A.bed somente com o nome do gene

  chr1-1
  chr1-10
  chr1-102
  chr1-106
  chr1-11
  chr1-2
  chr1-3

e eu sei que eles também em uma coluna de B.bed.

  chr1 startpos endpos chr1-1
  chr1 startpos endpos chr1-10
  chr1 startpos endpos chr1-102
  chr1 startpos endpos chr1-106
  chr1 startpos endpos chr1-11
  chr1 startpos endpos chr1-2
  chr1 startpos endpos chr1-3
  chr2 startpos endpos chr2-234
  chr12 startpos endpos chr12-23546

No entanto, por que

  cut -f4 B.bed > C.bed # only use the gene name column
  comm -1 -2 A.bed C.bed

encontre todos eles, mas

  grep -w -f A.bed B.bed

apenas encontre

  chr1-1
  chr1-2
  chr1-3

Porque comm não pode mostrar linhas inteiras no B.bed.

Como eu poderia usar o grep para chamar todas as linhas correspondentes no B.bed?

Ou como eu poderia chamar todas as linhas no arquivo B.bed com palavras correspondentes de uma coluna usando outro arquivo?