É para dar acesso a todo o sistema à sua conta do gmail (e possivelmente de outros usuários) para que softwares e extensões possam acessá-lo sem exigir que você dê permissão a cada um deles.
O fato de que o Gnome fornece essa funcionalidade não significa que os desenvolvedores realmente o usem, é um recurso bem novo e os softwares eventualmente serão recuperados.
Até onde eu sei, uma das poucas extensões que usam "contas on-line" é Gmail Notify