você precisa consertar seu arquivo /etc/fstab
, ele provavelmente tem dois swaps no Ubuntu e no Kali, apenas apague a partição que você não quer usar em cada um e reinicie.
Sobre a inicialização, sempre que você atualizar o grub em qualquer uma das duas distros, eles atualizarão seu arquivo /boot/grub/grub.cfg
e ele terá o último grub da distro atualizada mais recente (Kali é o azul e Ubuntu o roxo se eu não se engane) se você quiser apenas atualizar o grub uma vez, você pode desinstalar o grub de uma das duas distribuições e sempre que você atualizar a distribuição com grub
instalado, ela irá automaticamente reconfigurar e procurar a outra distro também. p>
Espero que ajude.