Você parece ter um pequeno erro de sintaxe ...
sudo su - SUPERUSE;/home/username/RTL_COUNTER.sh
significa ...
# su to a SUPERUSE + exit, because of the ";"
# execute the script as whatever use ssh'ed into machine
/home/username/RTL_COUNTER.sh
Tente isso ...
sudo su - SUPERUSE -- /home/username/RTL_COUNTER.sh
Observe o ";" removido personagem.