O motivo foi o armazenamento em cache do SRT.
Liguei para acelerar minha partição Win para jogos, e como meu SSD de armazenamento em cache tinha 64 GB (tamanho máximo atual para SRT), basicamente armazenava em cache tudo o que tinha em mãos desde que não tinha acabado espaço ainda para começar a purgar. Como tal, tudo o que o Windows pôde ver foi o conteúdo em cache, retirado do SSD, enquanto o Ubuntu (já que não há suporte SRT para ele) viu o estado atualizado.
Depois que eu desativei o SRT e reinicializei para limpar o cache manualmente, eles se comunicam com a partição sem falhas. Naturalmente, isso é inaceitável porque preciso do meu SRT no sistema operacional Win, portanto, basta conectar uma nova unidade para servir como o disco de compartilhamento. Dessa forma eu tenho alguma redundância também.
Obrigado pela ajuda a todos!