Então, aqui está o que eu encontrei:
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Depois de executar os comandos sugeridos e procurar nas guias, o problema parece resolver-se após algum tempo, leva muito tempo. Parece um trabalho para Bender. Então, paciência!
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O relógio XFCE e a hora do sistema não estão sincronizados. Enquanto a hora do sistema estava correta, o relógio XFCE estava errado até que o problema se resolvesse depois.
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O relógio Orage funciona melhor e encontra o horário correto mais rápido, mas não oferece suporte à transparência.