Os documentos do mitmproxy explicam como usar o iptables para redirecionar as portas 80 e 443.
Se você quiser executar o mitmproxy na mesma máquina, quase todos os outros métodos exigem a configuração do aplicativo que você deseja capturar para usar um proxy. Eu não tenho certeza do que rede- > wifi- > http proxy e https proxy faz, porque eu não tenho isso no meu sistema Debian, mas muitos aplicativos
Entenda uma variável de ambiente http_proxy , que você pode definir em ~/.profile ou explicitamente:
export http_proxy=http://localhost:8080/