Você pode simplesmente usar mais de um comando de espelhamento como este:
lftp -u uid,pwd \
-e 'mirror -c /home/dcr96/TCGA/dir1; mirror -c /home/dcr96/TCGA/dir2; exit;' \
sftp://[email protected]
Então, tudo que você precisa é de algum código shell que produza tal linha de comando na sua lista.
Você também pode gerar esse script lftp, que pode ser mais fácil de revisar e depurar antes de executar.
#!/usr/bin/lftp -f
open -u uid,pwd serapeum2.qib.pbtech
cd /home/dcr96/TCGA
# auto-generated from the list
mirror -c dir1
mirror -c dir2
# ...
exit
Observe que o comando mirror aceita um diretório de destino local. Você precisaria disso para manter os caminhos completos no caso de caminhos mais longos:
mirror -c path/to/dir1 path/to/dir1