Olá pessoal, encontrei a solução, removendo minha antiga pasta .Trash que estava lá, mas não estava funcionando:
sudo rm -rf /media/FILES/.Trash-1000
funcionou como um encanto, agora sou capaz de migrar para o lixo do nautilus. E tenho certeza de que, se eu criar um novo usuário, ele poderá ter seu próprio lixo também.