Compare os nomes das colunas em dois arquivos

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Eu tenho o primeiro arquivo com 1099 colunas

#rnaseq/SNPID   hg19Location    Gene    TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW- 
rnaseq  -       ?|100133144     7.8666  9.6884  22.3240 1.8760  2.0161  7.8383  5.3991  0.0857  4.5513  15.4363     15.0035 4.3578  0.6809  2.5364  12.4086 11.5839 

as colunas que quero comparar começam na coluna 3

TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW- 

o segundo arquivo tem 1119 colunas

 [1]#SNPID  hg19Location    Gene    AlleleA AlleleB dbSNP   nSample TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A- 
[2]SNP_A-1780270   chr7:78599583:- MAGI2|ENSG00000187391.13        C       G      rs987435 2236    1_0.002700      1_0.006000      1_0.000300      

as colunas que quero comparar começam com a coluna 8

TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A-

para que eu queira corresponder os nomes das colunas no primeiro arquivo ao segundo arquivo, para que o segundo arquivo tenha apenas os mesmos nomes de coluna que o primeiro arquivo

então basicamente eu quero os mesmos nomes de colunas em ambos os arquivos

    
por Marwah Soliman 15.02.2017 / 01:00

1 resposta

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Você quer fazer isso apenas para um arquivo? Além disso, as colunas são separadas por algo padrão, como uma guia ou uma vírgula? Se isso for verdade, a maneira mais simples provavelmente seria abrir os arquivos no LibreOffice Calc, definir o separador como ele é (por exemplo, guia) e copiar as colunas desejadas de um arquivo para outro. Se ao abrir o arquivo com o LibreOffice você não for solicitado a definir um separador, renomeie os arquivos para .csv primeiro.

    
por 15.02.2017 / 02:05