O problema está resolvido. No entanto, a descrição do meu problema não é precisa, pois algum cache aproveitou ao máximo o espaço em / var. Uma combinação dos dois links a seguir resolveu o problema:
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Verifique o uso do disco em / var, conforme descrito no link
No meu caso, eu tenho 6.5G em / var / cache / PackageKit / metadata / updates / packages
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Exclua os dados em cache neste diretório, conforme descrito em Fedora 23 - Posso excluir arquivos com segurança em / var / cache / PackageKit / metadata / updates / packages?