Espaço em disco (3TB) esgotado durante o funcionamento do LAMMPS

Question

Toda vez que eu corro LAMMPS por 4-5 dias, o espaço em disco (3TB) acabaria. Eu tentei encontrar arquivos temporários possíveis usando comandos como:

1. du -d 5

2. du -h --max-depth=1

3. du . | sort -nr | head -n50

No entanto, não consigo encontrar esses arquivos. O comando du mostra que o espaço em disco é usado por alguns arquivos no meu diretório de trabalho. Não parece haver arquivos grandes demais. Se eu reiniciar o servidor, o espaço será liberado. Como posso encontrar esses arquivos temporários e excluí-los com segurança? Ou qualquer outra solução será muito apreciada.

Saída de df -h após rodar LAMMPS por volta de 24 horas:

Filesystem               Size  Used Avail Use% Mounted on
rootfs                   3.5T  1.2T 2.2T  35%  /
udev                     10M   0    10M   0%   /dev 
tmpfs                    6.4G  2.0M 6.3G  1%   /run 
/dev/mapper/cosmos-root  3.5T  1.2T 2.2T  35%  / 
tmpfs                    5.0M  0    5.0M  0%   /run/lock 
tmpfs                    13G   315M 13G   3%   /run/shm 
/dev/sda2                229M  18M  199M  9%   /boot

Por favor, não marque arbitrariamente a minha pergunta como duplicada!

    

Answer 1

Como tudo parece estar montado em uma grande partição raiz, os comandos du claramente não estão voltados para onde deveriam estar. Talvez você esteja executando du em algum subdiretório de /home , mas LAMMPS está preenchendo arquivos de log em /var ou /var/log .

Execute isso em um terminal de segundo plano durante o preenchimento, ele mostrará os dez maiores arquivos abertos por qualquer processo chamado " lammps * " ou " lmp * ", e também destacar as alterações à medida que esses arquivos maiores crescem:

watch -d "lsof -c lammps -c lmp | tr -s ' ' | cut -d' ' -f8,9 | sort -urn | head"

Nota: o código acima assume que o espaço em disco é consumido por alguns arquivos grandes e em crescimento. É possível que o espaço em disco também possa ser consumido por milhões de arquivos pequenos.