Uma possibilidade é usar o comando de backup do dsync. Esta é uma replicação unidirecional do sistema antigo para a nova configuração, tendo o novo servidor Dovecot atuando como um cliente IMAP. O dsync pode não apenas ser usado entre diferentes versões do dovecot dessa maneira, mas também para migrar dados de outros servidores IMAP. Colocar um proxy na frente, você pode até fazer a migração ao vivo de grandes bases de usuários sem que ninguém perceba se feito corretamente.
Para uma configuração pequena (até algumas centenas de gigabytes de informações de e-mail, algumas centenas de usuários), pode ser mais razoável apenas atualizar o sistema de e-mail existente ou rsyncar os dados de e-mail para o novo sistema em um curto período de inatividade. Configurar o dsync envolve um bom esforço de preparação.