Reconstruindo um pacote personalizado do zero

Question

Eu construí e instalei um pacote chamado to-build .

Minha hierarquia de arquivos é assim:

$HOME/usr/
    src/
        to-build/
    packages
        bin/     include/ lib/     share/  

Eu criei e instalei o to-build dessa maneira:

$ cd $HOME/usr/src/to-build
$ mkdir builddir
$ cd buiddir
$ ./configure --prefix=$HOME/usr/packages
$ make 
$ make install

Digamos que eu instalei outros pacotes em $HOME/usr/packages e tenho que recompilar do zero to-build porque esqueci de especificar um parâmetro com o comando configure . Posso simplesmente executar os comandos configure, make, make install ou excluir arquivos que foram instalados anteriormente em $HOME/usr/packages ? Se este último, como posso saber com certeza quais arquivos em $HOME/usr/packages estão relacionados a to-build ?