Sua fonte provavelmente não é ZFS? Caso contrário, zfs send|zfs receive seria recomendado.
Você pode dizer a rsync para realizar transferências no local, a partir de man rsync :
--inplace This option changes how rsync transfers a file when its data needs to be updated: instead of the default method of creating a new copy of the file and moving it into place when it is complete, rsync instead writes the updated data directly to the destination file.
Por favor, leia o manual mais sobre os efeitos usando --inplace .