Como mencionado em link
'- nolisten tcp' agora é o padrão, portanto, o servidor só aceita conexões locais em um soquete de domínio unix. Uma opção '-list' foi adicionada e pode ser usada para restaurar o comportamento anterior.
É assim que você pode anular a opção "-nolisten tcp" e executar xserver automaticamente :
<path-to-cygwin>\bin\run.exe -p /usr/X11R6/bin XWin -listen tcp -multiwindow -clipboard -silent-dup-error