Você pode fazer
sudo find / -xdev -type f -size +1000k -mtime -20 -ls
por exemplo, para encontrar arquivos maiores que 1000 kibibytes que foram alterados nos últimos 20 dias. O -xdev mantém você na partição /. Obviamente, você não deve excluir esses arquivos, mas talvez você encontre algum log ou cache grande que possa limpar. Você provavelmente terá que remover um pacote. Você pode obter o tamanho de cada rpm com
rpm -qa --queryformat '%{SIZE} %{NAME}\n' | sort -nr | less