Como ninguém teve qualquer ajuda aqui, queimei o atual disco Live, que tinha um kernel mais novo e a versão corrigida do xfsprogs. Do disco ao vivo, eu pude executar o xfs_repair e resolver os problemas. isso ainda falhava no modo de emergência, mas consegui executar o xfs_repair a partir da instalação nativa, o que me permitiu voltar ao sistema.