Se você instalou o Kali Linux após o Windows 10, então o processo de inicialização para o Windows provavelmente está passando pelo bootloader grub instalado com o Kali.
Isso provavelmente significa que o seu setor de inicialização de SSDs carrega o grub do HDD e redireciona (ao selecionar o Windows) para o SSD para inicialização adicional.
Não é possível remover o HDD em tal situação sem interromper o processo de inicialização, pois você removerá o grub e seu menu de configuração. O que você precisa fazer antes é restaurar o windows bootsector no SSD e restaurá-lo quando quiser usar o Kali novamente.
Eu recomendo que você salve o bootsector atual em algum dispositivo USB, para que você possa restaurá-lo após a inicialização de uma instalação do Live USB (a menos que você tenha uma maneira de restaurar o bootsector no Windows).