O Linux tem suporte a USB embutido na maioria dos kernels, então instalar e inicializar a partir de uma unidade USB é bom (ao contrário das instalações padrão do Windows que carregam drivers USB mais tarde no processo de inicialização), você deve ser capaz de carregar a maioria dos instaladores da Pen drive USB, e instalá-lo em outro pen drive USB, e depois usá-lo como um disco rígido removível ... Tudo deve ser "persistente" e o sistema operacional irá tratar o pen drive essencialmente como um disco rígido. Eu fiz isso com o Mint por algum tempo antes de um thumb de 64GB ser muito pequeno, mas atualizações e outros ajustes ou mudanças não foram um problema e foram armazenados como se a unidade fosse um disco rígido.