Eu entendo que no Gnome isso não é possível. Agora o Wayland está em desenvolvimento e é possível que o projeto Wayland não inclua esse recurso.
É muito triste que o Ubuntu esteja deixando o Unity porque um dos recursos mais interessantes (opinião pessoal) do Unity é o menu de aplicativos integrado.
Na semana passada, o OMG Ubuntu anunciou que Lester Carballo não funcionaria mais no Global Menu Extension: Extensão do Menu Global do GNOME 'Descontinuado no Momento' .