Como os comentários mencionaram, provavelmente há algo errado com o seu disco. Meu primeiro pensamento seria verificar o espaço em disco. Verifique novamente o sistema de arquivos também (por exemplo, snapshots do btrfs).
df -h
Em seguida, vai para as permissões de arquivo (chmod etc) e falhas de disco reais. Tente escrever ou tocar arquivos em outros diretórios / partições
touch ~/yayfile.txt
touch /yayfile.txt