Eu não consigo lembrar que o NetBeans está nos repositórios, mas por causa do controle do meu ambiente de desenvolvimento, pelo menos no mundo java eu sempre uso os pacotes de vendedores, ie eu baixo o arquivo zip do netbeans (de este diretório de download ) e vincule os scripts apropriados a /usr/local/bin .
Eu também baixei o Java SDK da Oracle (com as opções engraçadas dos SDKs no Ubuntu), mas isso é outra história ...