Eu nunca encontrei alguns problemas como este, eu usei várias vezes vários monitores (2) para mostrar como o Ubuntu (karmic e Lucid) pode manipulá-lo e tudo estava limpo. Eu não precisei de nenhuma ferramenta de configuração especial entre "Sistema - > Preferências - > Monitores" Eu apenas conectei e toquei. Pode ser que o problema seja de uma edição antiga do Ubuntu, eu apenas tentei com o Karmic e o Lucid