Um pouco exagerado, mas você pode usar o comando 'dd' para isso. 'dd' significa Disk Dump, e irá despejar uma cópia exata, pouco a pouco, de um disco rígido em um arquivo. Eu só usei isso para criar arquivos iso de CD e DVD, então eu não sei se há algo específico ao usar um disco rígido ... Mas vale a pena investigar.
Para criar um ISO para um CD, o comando é:
dd if = / dev / cdrom de = / caminho / para / file.iso
Você pode ler mais sobre dd em sua página man (man dd), e provavelmente há um tutorial em algum lugar para exatamente o que você quer online. Aqui está uma que eu encontrei com uma rápida pesquisa no google: link
Edit: Eu não sei se isso é relevante ou não, mas os CDs são geralmente somente leitura, enquanto o seu disco rígido provavelmente não é ... E provavelmente é ter dados gravados nele mesmo quando você não percebe isto. Portanto, é provavelmente uma boa ideia executar esses comandos a partir do LiveCD, e não do disco rígido que você está tentando fazer backup.