Remover o meta-pacote geralmente não será um problema até que você tente atualizar seu sistema, mas eu aconselharia contra ele. A remoção do gedit e de alguns outros aplicativos padrão também pode ser problemática - se outros programas dependerem deles. É melhor que você os deixe no lugar a menos que você saiba o que está fazendo. Se você quiser construir seu próprio sistema personalizado mínimo, tente usando ubuntu-minimal .