O Notepad ++ não funciona imediatamente via Wine com o software Firefox instalado.
Você precisará instalar o Firefox no Wine para que ele funcione, usando o instalador do Windows para o Firefox. O Notepad ++ deve então funcionar com o Firefox no Wine.
Uma alternativa ao Notepad ++ é o software gedit
já instalado. Ele faz a maioria das mesmas funções do Notepad ++ em termos de realce de sintaxe e tal, e vem incluído no Ubuntu.