Você está esquecendo de fornecer um argumento obrigatório.
Usage: eui_install.py [ZIPFILE]
significa que você precisa incluir o nome de um arquivo zip. O comando é:
python eui_install.py zipfile
onde zipfile é um nome de arquivo que você precisa fornecer (provavelmente o mod que você deseja editar olhando para o script).
Os arquivos na pasta designada ainda possuem nomes com letras maiúsculas. O que estou fazendo errado?
Esses arquivos são o que você precisa adicionar ao comando (ou seja, o segundo argumento é um arquivo zipado).