Corri para o mesmo problema após atualizar de 16.04 LTS para 16.10. Reinstalar o xserver-xorg-input-all
resolveu o problema.
sudo apt install --reinstall xserver-xorg-input-all
Minha primeira tentativa de reinstalar apenas xserver-xorg-input-synaptics
corrigiu o problema com o touchpad, mas quebrou a entrada do teclado (no teclado da tela para o resgate).
Isso foi em um Dell XPS 13 9350.