Por padrão, o gerenciador de arquivos do Ubuntu não tem a opção de abrir pastas com permissões elevadas; você precisa de nautilus-admin plugin para isso.
Abra Software Center e procure por nautilus-admin package. Instale-o. Depois que o plug-in tiver sido adicionado, pare o gerenciador de arquivos (o comando para isso é nautilus -q ) e reinicie-o.
Agora, você pode copiar e colar arquivos no gerenciador de arquivos com permissões de administrador, se clicar com o botão direito do mouse no corpo da pasta e selecionar "Abrir como administrador".
No entanto, se a pasta em que você tenta copiar o arquivo tiver permissões diferentes do usuário root, por exemplo userA:userA , você precisará usar a linha de comando para se adicionar ao grupo userA (considerando que você tem sudo privileges). Não há uma maneira de fazer interface gráfica para fazer isso!