Você não pode se livrar de uma partição GPT. O GPT é um tipo de tabela, como é uma tabela de partições do MBR. Como parece que você tem um disco de instalação do Windows 8, é sempre possível desabilitar o UEFI e instalar os dois sistemas operacionais no CSM (modo BIOS legado) com uma tabela de partições MBR.
Se você deseja instalar no UEFI, use o GPT para ambos os sistemas operacionais. Se o Ubuntu não estiver reconhecendo suas partições, abra o Gparted no live-cd do Ubuntu e verifique se ele vê a tabela. Eu sugeriria criar a tabela de partições no Gparted, instalar o Windows e depois instalar o Ubuntu.