Eles não são necessariamente.
Eles especificaram as taxas de quadros em um linux mais minimalista (Ubuntu sem Unity para tirar peso da placa de vídeo) e Left4Dead2 tinha MELHORES taxas de quadros no linux. Entendo que o TF2 roda no mesmo motor, então, em teoria, se você estivesse executando algo como o XFCE em vez do Unity, ele teria melhores taxas de quadros no mesmo hardware.
Veja os tópicos aqui que falam sobre como obter mais desempenho dos jogos de vinho (que devem ser executados mais lentamente por causa de uma camada de abstração extra). Se você ajustar sua caixa, você obterá melhores taxas de quadros em jogos nativos do Linux do que os jogos nativos do Windows como regra geral.