A Canonical não vai parar de fazer a versão desktop. Eles não vão mais gastar dinheiro com Unidade e convergência. Tudo isso significa para o usuário final que as versões futuras do Ubuntu serão gnome (assim como os outros sabores oficiais) que não haverá mais o Unity DE.
Veja este artigo da Mark Shuttle (Fundador da canonical) especificamente no parágrafo 2. link