Você pode configurar para o Gnome se a área de trabalho deve mostrar itens / ícones ou não usando várias maneiras
Usando o gnome-tweak-tool
Instalar
sudo apt install gnome-tweak-tool
Deve parecer de alguma forma assim
Usando gsettings do terminal
gsettings set org.gnome.desktop.background show-desktop-icons
Você pode precisar reiniciar o nautilus para concluir a alteração
nautilus -q
nautilus