Estou com o mesmo problema das versões anteriores do Ubuntu. A solução para o problema do 11.10 era usar o link , mas para o 12.04 eu não encontrei uma solução isso funciona.
Netbook HP 210-1095tu Atom n450 RAM 2 GB
Eu tive esse problema (clique com o botão direito do mouse não funciona) com o Ubuntu 12.04, e achei este link muito útil:
No meu caso, tudo que eu tinha que fazer era definir a área do botão direito, adicionando a linha
Option "SoftButtonAreas" "50% 0 82% 0 0 0 0 0"
para o arquivo de configuração, conforme explicado lá.
Eu tenho o mesmo problema e essa solução alternativa não tem efeitos colaterais. Eu estou rodando o Ubuntu Server 12.04 com o gnome-shell 3.4 nele (para esse rápido, bare bones gui sem todos os pacotes pré-carregados). Com dois dedos, toque duas vezes no touchpad e mantenha-se pressionado no segundo toque e, em seguida, levante um dedo para mover o ponteiro do mouse. Nota: deve ter a opção Ativar cliques do mouse com touchpad marcada nas Configurações do sistema > Mouse e Touchpad. Na minha máquina, parece que se comporta como se o botão direito do mouse estivesse pressionado. Quando você soltar o segundo dedo, o que estiver sendo apontado pelo ponteiro do mouse será clicado com o botão direito. Sem efeitos colaterais que eu possa encontrar. Eu ainda prefiro o trabalho com o botão direito do mouse, mas aceito por enquanto.
Você deve usar o comando abaixo se tiver seguido o comando echo options psmouse proto=exps > /etc/modprobe.d/psmouse.modprobe this.
Por favor, não use o comando acima ou se você o usou, então abaixo há uma solução para reverter
sudo rm /etc/modprobe.d/psmouse.modprobe
sudo reboot
sudo su
echo options psmouse proto=exps > /etc/modprobe.d/psmouse.modprobe
reboot
Isso tem alguns efeitos colaterais: você pode perder outros recursos do touchpad, como a rolagem com dois dedos. Na verdade, isso remove a guia do touchpad da janela de configurações de configuração do mouse.