Depois de redefinir minhas configurações da nVidia para os padrões de fábrica e reiniciar o computador, as caixas desapareceram. Não tenho certeza do que causou isso, já que não alterei minhas configurações da nVidia.
Estas caixas pretas aparecem depois de reiniciar o computador e elas piscam. Não tenho certeza de onde eles vieram e eles ocorrem antes de eu acessar o meu computador. Estou executando o Ubuntu 12.10 e tenho uma placa gráfica da nVidia e tive que desativar o sistema gráfico padrão que vem com o Ubuntu.
Se precisar de mais informações, me avise.
Desculpe por ter usado uma foto da minha tela, as caixas não foram exibidas em uma captura de tela.
Depois de redefinir minhas configurações da nVidia para os padrões de fábrica e reiniciar o computador, as caixas desapareceram. Não tenho certeza do que causou isso, já que não alterei minhas configurações da nVidia.
A mesma coisa aconteceu comigo às vezes em 12.10, e aconteceu consistentemente em 13.04. Eu estou usando o driver nvidia proprietário (eu tenho o 8400GS) e o problema persistiu através da tentativa de diferentes versões do driver.
Depois de olhar em volta, descobri que era o módulo vesafb que estava causando o problema (você provavelmente notará algumas reclamações do dmesg sobre o vesafb). Depois que eu descomentei o 'blacklist vesafb' em /etc/modprobe.d/blacklist-framebuffer.conf, o problema desapareceu.
O único problema agora é que perdi meu ttys e ainda estou tentando descobrir como recuperá-lo.