Se você não quiser que alguém formate seu flashdisk, não dê acesso a ele. Mesmo que o seu flashdisk tenha um switch de hardware para proteção contra gravação como o SD-Card, qualquer um pode facilmente usá-lo para desativar a proteção contra gravação. Então, sua melhor aposta é manter seu flash seguro em sua gaveta e travar a gaveta.
Eu sugiro que você obtenha um armazenamento em nuvem e mantenha arquivos importantes lá. Existem serviços gratuitos disponíveis como o DropBox.
E apenas por causa da informação, aqui está uma lista de flashdrives com botões físicos de proteção contra gravação link