O gerenciamento de repositório baseado em GUI é normalmente realizado via "Software Sources". Essa interface pode ser acessada através de vários métodos. Para as versões mais recentes do Ubuntu, a maneira mais fácil é percorrer o "Ubuntu Software Center". Abra o centro de software e, a partir do menu Editar, selecione "Fontes de software". Você terá que digitar sua senha para alterar as configurações nesta janela.
Selecione a guia "Outro Software" e desmarque o repositório em questão. Isso desabilitará o repositório (você pode reativá-lo dessa maneira também).
Fonte: Repositórios do Ubuntu