O Ubuntu não vem com antivírus, depende das permissões do usuário e das atualizações de segurança para evitar a infecção. Além disso, a maioria das ferramentas antivírus disponíveis para o linux NÃO procura vírus linux, eles apenas examinam vírus baseados no Windows. A abordagem de atualizações e permissões torna difícil para um vírus infectar um sistema, e é muito difícil determinar se um sistema Linux possui arquivos que contenham código viral. É uma das maiores desvantagens do Ubuntu aos meus olhos, porque muitas pessoas acabam ajudando inconscientemente a espalhar código viral para outros sistemas. No entanto, deve-se notar que não existem muitos vírus para o Linux (até onde sabemos).
Comodo Antivirus For Linux é um dos melhores antivírus gratuitos que eu encontrei para o Ubuntu, ele vem em 64 bits e 32 bits, mas só verifica vírus do Windows. Também não funciona em todas as versões do Ubuntu devido a problemas de driver.
O ClamAV é um antivírus simples de varredura manual apenas para 32 bits e 64 bits, que só detecta novamente
vírus do windows.
Pessoalmente, sugiro a execução de um antivírus com verificação manual do Windows no vinho, pois você terá uma seleção melhor e, de qualquer forma, você só detectará vírus do Windows.