Execute find /search/dir -user root
e verifique se ele lista os arquivos apropriados.
A alteração automática dos arquivos do sistema a partir da propriedade raiz fará coisas ruins com seu sistema, portanto, certifique-se de que isso apenas localize os arquivos que você deseja alterar.
Em seguida, sudo find /search/dir -user root -exec chown myuser {} \;
mudará a propriedade desses arquivos.