Eu mudei para o Gnome Shell e editei as configurações do gconf desktop > gnome > shell > windows button_layout =: minimizar, maximizar, fechar
Os botões estão lá, mas eles não usam mais o tema do Gnome Shell, mas parecem com os do Unity (pequenos botões redondos, com o próximo sendo laranja e os outros dois brancos).
Como faço para que os botões fiquem como deveriam novamente?
Você tem que restaurar seu windows e o tema gtk, instalar o gnome-tweak-tool e escolher para todo o tema Adwaita. Você também pode ativar os temas do usuário gnome-shell-extensions para alterar seus temas com mais facilidade. Você pode encontrar um ppa com as extensões e instruções aqui .