Se você não desabilitar o Secure Boot, não será possível instalar módulos do kernel de terceiros, como vídeo proprietário ou drivers sem fio.
Não sabemos se você precisa de algum software de terceiros ou não.
Você pode mantê-lo ativado se não precisar deles. Outra limitação é que a hibernação não funciona no Ubuntu com inicialização segura ativada.
O Secure Boot é um mecanismo no UEFI que verifica assinaturas do kernel do sistema operacional e não permite carregar sistemas operacionais ou módulos não assinados.
Nada de terrível acontecerá se você desativá-lo. Não é um recurso muito útil na prática.