Adicione o disco a /etc/fstab . Você cria um backup e pode editar o arquivo com estas duas linhas:
sudo cp /etc/fstab /etc/fstab.old
gksudo gedit /etc/fstab
Exemplo:
Isso pressupõe que sda3 é sua partição ntfs e deve ser montada em /media/windows/
/dev/sda3 /media/windows ntfs defaults 0 0
Portanto, altere sda3 para o seu nome de partição e o nome do diretório windows para algo que você goste mais. Você pode usar o fdisk para ver o que o ntfs é chamado no Ubuntu:
sudo fdisk -l