Se os drivers da Nvidia tiverem sido instalados a partir dos repositórios ou de um PPA com o DKMS, ele não "morrerá" após a atualização do kernel.
Os drivers da AMD são atualizados, porque o Ubuntu tem drivers de código aberto pré-instalados para muitas GPUs.
Sugiro que atualize todos os pacotes sugeridos e instale os drivers da Nvidia corretamente se houver um problema com eles.