Obrigado @ Pilot6 e @OrganicMarble pela sugestão. apenas se alguém mais estiver enfrentando o problema: Acabei usando
sudo nano /etc/apt/sources.list
que me ajudou a substituir a restrição de permissões e a modificar o arquivo.
Acabou de mudar a linha 54 para
deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial[type]