Veja o espaçamento da segunda coluna após python ./
. Esses arquivos (exceto "analysis3.pyo") têm um espaço no início do nome do arquivo.
Você pode renomear os arquivos com isto:
for file in " "*; do
mv "$file" "${file#' '}"
done
Ou se você precisar manter os nomes dos arquivos do jeito que eles são, você pode usar o preenchimento automático da seguinte forma:
$ python " a
Pressione Tab
$ python " analysis